基于代价敏感LSTM网络的蛋白质域检测方法及系统

  • 国民经济行业:制造业/计算机、通信和其他电子设备制造业
  • 权利人:上海交通大学

知识产权简介

一种基于代价敏感LSTM网络的蛋白质域检测方法,采用双向LSTM网络作为蛋白质域检测的模型;提出一个代价敏感的损失函数,为正负样本的错分赋予不同的代价;同时提出一种更新损失函数中代价权重的方法,对于任意给定的初始值,能够在网络训练过程中自适应地更新代价权重。采用平滑、删除、合并操作对模型的原始输出进行后处理。本发明优点包括:检测模型采用双向LSTM网络,对蛋白质序列的长程相关性进行有效建模;使用代价敏感的损失函数训练模型,适应蛋白质域数据集不平衡的特征;引入代价权重自适应更新方法,适用于任何数据集;对模型输出进行后处理,减少假阳性结果。

基本信息

权利人 上海交通大学
知识产权类型 专利
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