一种多基因组共有序列高速识别方法、系统及应用
知识产权简介
本发明公开了一种新的多基因组共有序列的高速识别方法，该方法既可以针对物种的蛋白质组序列，也可以针对全基因组核酸序列进行与其他物种多基因组共有序列的高速识别。本专利内容包括：构建多基因组核酸和蛋白质序列的目标数据库；对目标基因组及蛋白质序列进行划分并聚类，构建预比对序列；利用序列比对方法预比对序列比对到目标数据库；对比对后的序列结果进行相似性筛选，拼接，以及物种来源识别和分类；按照不同要求输出在不同物种中共有的核酸或蛋白质序列结果等。由于该方法可以快速在目前所有测序后的物种进行快速序列识别，并可以识别不同生物之间相似度较低的共有序列（包括物种的全基因组核酸序列以及蛋白质序列），极大的提高了共有序列识别的广泛性与可能性，并减少由于不同物种间共有序列因序列变异导致的低相似度序列无法识别的假阴性可能。
转化前景
本发明公开了一种新的多基因组共有序列的高速识别方法，该方法既可以针对物种的蛋白质组序列，也可以针对全基因组核酸序列进行与其他物种多基因组共有序列的高速识别。本发明应用实例包括蝙蝠与非哺乳动物共有序列搜寻、寄生虫与其宿主和共生微生物之间特有共有功能蛋白序列的搜寻等。对测序污染，寄生虫防控以及精准医学等领域有应用前景。